Název: Diverzita kryptosporidií infikujících hlodavce podčeledi Arvicolinae v České republice
Překlad názvu: Diversity of Cryptosporidium spp. infecting rodents from subfamily Arvicolinae in the Czech Republic
Autoři: HÁJKOVÁ, Ivana
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Souhrn V roce 2012 byl sledován výskyt Cryptosporidium v České republice u podčeledi Arvicolinae, za účelem zjištění prevalence a porozumění úlohy divokých hlodavců v souvislosti s přenosem tohoto parazita - na lidi a hospodářská zvířata. Celkově bylo odebráno 152 vzorků trusu, 129 od hrabošů polních (Microtus arvalis) a 23 od norníků rudých (Clethrionomys glareolus) z 9 různých lokalit. Všechny vzorky byly vyšetřeny na přítomnost Cryptosporidium sp. pomocí specifického barvení anilin-carbol-methyl violetí a pomocí molekulárních metod. Při odběru vzorků byl zjišťován věk a pohlaví zvířat, rovněž i konzistence trusu. Mikroskopické vyšetření odhalilo přítomnost oocyst Cryptosporidium sp. u 2 vzorků hraboše polního a 2 vzorků norníka rudého. Molekulární genotypizace byla provedena na základě PCR amplifikace genů kódující malou ribozomální podjednotku (SSU rRNA) a aktin. Specifická DNA kryptosporidií byla detekována v deseti vzorcích, z toho 4 z hraboše polního a 6 z norníka rudého, včetně těch mikroskopicky pozitivních. U žádného pozitivního zvířete nebyly pozorovány klinické příznaky kryptosporidiózy. Sekvenční a následné fylogenetické analýzy prokázaly přítomnost 2 nových genotypů Cryptosporidium izolovaných z norníka rudého a 2 genotypů izolovaných z hraboše polního, fylogeneticky odlišných od dosud známých druhů a genotypů. V budoucnu je třeba prověřit hostitelskou specifitu pomocí experimentálních infekcí. Abstract In order to examine the prevalence of Cryptosporidium in wild Arvicolinae in the Czech Republic and understand the role that wild rodents play in the transmission of this parasite to humans and livestock, 152 faecal samples from 129 common voles (Microtus arvalis) and 23 bank voles (Clethrionomys glareolus) were collected on 9 localities in 2012. All samples were examined for presence of Cryptosporidium sp. using both the aniline-carbol-methyl violet staining method and molecular tools. The age, sex and faecal consistency were noted at the time of sampling. Microscopical examination revealed the presence Cryptosporidium sp. oocysts in 2 samples originated from common voles and 2 samples from bank voles. Genotyping was done through PCR amplification and characterization of the SSU rRNA and actin loci. Cryptosporidium specific DNA was detected in 10 samples (4 from common voles and 6 from bank voles) including those microscopically positive. Cryptosporidium infection was not linked to diarrhoea. Sequence and following phylogeny analyses revealed two new Cryptosporidium genotypes originated from bank voles and two new genotype from common vole, phylogeneticaly distinct from known species and genotypes. The host specificity needs to be verified by experimental infection in the future.
Klíčová slova: Cryptosporidium; fylogenetika; hrabošovití; PCR; prevalence; Arvicolinae; Cryptosporidium; PCR; phylogeny; prevalence
Citace: HÁJKOVÁ, Ivana. Diverzita kryptosporidií infikujících hlodavce podčeledi Arvicolinae v České republice. České Budějovice, 2013. diplomová práce (Ing.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/28234

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-154323


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce