Název: Laterální genový přenos a jeho využití ve fylogenetice eukaryot
Překlad názvu: Lateral gene transfer and its utilisation for the phylogeny of eukaryotes
Autoři: Novák, Lukáš ; Hampl, Vladimír (vedoucí práce) ; Čepička, Ivan (oponent)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2011
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
K laterálnímu genovému přenosu dochází u eukaryot relativně vzácně. Proto může být přítomnost konkrétního laterálně přeneseného genu u více linií eukaryot považována za jejich společnou synapomorfii, která je definuje jako monofyletickou skupinu. Na rozdíl od běžných fylogenetických postupů dokáže tento přístup potenciálně odhalit i směr evoluce a pozici kořene evolučního stromu. V první části této práce diskutuji různé aspekty využití laterálního genového přenosu ve fylogenetice eukaryot včetně výhod a nevýhod oproti běžným postupům. Ve druhé části pak představuji jednotlivé studie, které v minulosti tuto metodu využily. Klíčová slova: Laterální genový přenos, vzácné genomové změny, artefakt přitahování dlouhých větví, endosymbióza, fylogenetika, eukaryota, protista. Lateral gene transfer is a relatively rare event in eukaryotes. Presence of a specific gene acquired by lateral transfer in multiple lineages can be therefore considered to be their common synapomorphy, defining them as a monophyletic group. In contrast to usual phylogenetic methods, this approach can potentially shed light even on the direction of evolution and therefore find the position of a root of a given group of organisms. In the first part of this work I discuss various aspects of lateral gene transfer utilisation in eukaryote phylogeny including advantages and disadvantages against common approaches. In the second part I present particular studies that have recently used this method. Key words: Lateral gene transfer, rare genomic changes, long branch attraction artefact, endosymbiosis, phylogeny, eukaryots, protists.
Klíčová slova: eukaryota; fylogeneze; Laterální genový přenos; eukaryotes; Lateral gene transfer; phylogeny

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/36594

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-300862


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce