Název: Fylogeografie a invazní cesty druhu Proasellus coxalis s.l. (Crustacea: Isopoda)
Překlad názvu: Phylogeography and dispersal routes of the Proasellus coxalis s.l. (Crustacea: Isopoda)
Autoři: Koprnická, Markéta ; Sacherová, Veronika (vedoucí práce) ; Šanda, Radek (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Schopnost disperze sladkovodních bezobratlých je ovlivněna mnoha faktory. V současné době v ní hraje podstatnou roli také člověk. Mimo jiné stavbou plavebních kanálů zničil přirozené hranice mezi povodími a umožnil tak šíření druhů na nová území. Tato práce na základě genetických dat určuje možné invazní cesty nepůvodního druhu P. coxalis s.l. do České republiky a snaží se zhodnotit jeho fylogeografii v rámci České republiky. Byl osekvenován gen COI a 28S. Do analýz bylo zahrnuto 96 jedinců z 27 populací z České republiky. Z volně přístupné databáze GenBank bylo staženo 40 sekvencí genu pro COI a 7 sekvencí genu 28S. Na území České republiky se nacházejí dvě odlišné genealogické linie P. coxalis s.l. (6% rozdíl mezi sekvencemi genu pro COI). Jedna pochází z recentní invaze z mediteránní oblasti (přes západní invazní koridor a další plavební kanály). Druhá linie je na našem území nejspíše původní a mohla by spadat do poddruhu P. coxalis septentrionalis. Výsledky jsou diskutovány. Klíčová slova: Proasellus coxalis s.l., COI, invazní cesty, fylogeografie Dispersal of freshwater invertebrates is affected by many factors. Recently, human activities played a very important role in their dispersal. Among others, constructions of new shipping canals damages natural boundaries and the species can spread into new areas. This Master thesis deal with non-indigenous species P. coxalis s.l. On the genetic bases assess a possible dispersal routes into the Central Europe (and the Czech Republic), and phylogeography of this species in the Czech Republic. I amplified and sequenced DNA of the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) gene and 28S nuclear rDNA gene. 96 individuals from 27 localities in the Czech Republic were analyzed. I also included 40 sequences of the COI gene and 7 of the 28S gene from the GenBank database. In the Czech Republic, there are two different genealogic lineages of P. coxalis (with 6% genetic distance between sequences of the COI gene). The first lineage comes from recent invasion of this species from Mediterranean area (through Western invasion corridor and other shipping canals). The second lineage is probably indigenous in the area and it can probably be assigned to the subspecies P. coxalis septentrionalis. The results are discussed. Keywords: Proasellus coxalis s.l., COI, dispersal routes, phylogeography

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/54346

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-323640


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce