Název:
Příbuzenské vztahy a genový tok mezi plemeny kura domácího
Překlad názvu:
Relatedness and gene flow between breeds of the domestic fowl
Autoři:
Buchtová, Lucie ; Vinkler, Michal (vedoucí práce) ; Trefil, Pavel (oponent) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2016
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Kur domácí patří mezi druhy domácích zvířat s ohromnou hospodářskou a ekonomickou hodnotou. Vzhledem k těmto hodnotám je větší důraz kladen na jeho vysokoprodukční linie, které se svou produkcí jen těžko dají srovnávat se zájmovými liniemi či rurálními populacemi. Postupně díky upřednostňování většího výnosu zájmová plemena upadají do pozadí a zvyšuje se riziko ztráty genetické variability, kterou tato plemena disponují. Této problematice je však naštěstí v poslední době věnována poměrně velká pozornost, která vede ke snaze tyto zdroje genetické variability zachovat. Na vybraném vzorku 272 jedinců reprezentujících 33 zájmových plemen jsem hodnotila jejich míru variability pomocí analýzy dvaceti vybraných neutrálních markerů (kontrolní oblast mtDNA a 19 mikrosatelitových lokusů) a čtyř imunitních genů (TLR3, TLR4, TLR5, TLR7). U vybraných plemen bylo cílem zmapovat hrubý rámec původu moderních plemen mezi starobylými plemeny, identifikovat jejich možný geografický původ, porovnat míru neutrální a funkční variability mezi plemeny s mírou variability uvnitř plemen samotných a následně srovnat míru sdíleného polymorfismu (genového toku / ancestrálního polymorfismu) na neutrálních znacích a imunitních genech. Výsledky ukázaly, že je možné plemena geneticky rozlišit a pomocí detekce sdílených znaků...Domestic chickens are domestic animals with tremendous economic value. Due to this value, high-production lines have more important role for humans than fancy breeds and rural populations. Production traits of these high-production lines are not comparable with traditional breeds. The preference for larger profit gradually diminishes the importance of the traditional breeds, which leads to their replacement increasing the risk of loss of their genetic variability. Despite this trend, general awareness of this problem increses providing hope in saving these rich sources of genetic variation. We selected sample of 272 individuals representing 33 traditional (fancy) breeds. I evaluated the degree of variability through the analysis of twenty selected neutral markers (mtDNA control region and 19 microsatellite loci) and four immune genes (TLR3, TLR4, TLR5, TLR7). The main aims were: to map the origin of modern breeds between ancient breeds, identify the possible geographic origin of the breeds, to compare the rate of neutral and functional variation between breeds with the level of variation within breeds and to compare the degree of shared polymorphism (gene flow / ancestral polymorphism) of neutral markers and immune genes. The results show that we can genetically differentiate breeds and identify...