Název: Lidská lymfopoéza a její výzkum pomocí single-cell analýzy
Překlad názvu: Human lymphopoiesis and its examination via single-cell analysis
Autoři: Novák, David ; Kalina, Tomáš (vedoucí práce) ; Drbal, Karel (oponent)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2018
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Development of human B-lymphocytes is a convoluted process. A self-renewing stem cell progenitor in a primary lymphoid tissue commits to the lymphoid lineage. Subsequent B-lineage commitment entails somatic gene recombination processes which lead to the eventual expression of a surface antigen receptor. Functionality of the B-cell receptor, as well as successful testing for autoreactivity by the cell, are preconditions for the differenti- ation of a mature B-lymphocyte. Processes within this development are often investigated using single-cell analysis via flow cytometry, fluorescence-activated cell sorting and mass cytometry. Coupling these high-throughput methods with modern approaches to data analysis carries enormous potential in revealing rare cell populations and aberrant events in haematopoiesis. Keywords: B-lymphocyte, lymphopoiesis, flow cytometry, FACS, mass cytometry, clus- ter analysis, FlowSOM, PCA, t-SNE, Wanderlust. Vývoj lidských B-lymfocytů je spletitým dějem. Samoobnovující se kmenový progeni- tor v primární lymfoidní tkáni je nejdříve předurčen k vývoji v lymfoidní linii. Vývoj B-buněčnou cestou pak zahrnuje somatické genové rekombinace, které vedou k expresi povrchového antigenního receptoru. Funkčnost B-buněčného receptoru a podrobení buňky testování na autoreaktivitu jsou podmínkami pro diferenciaci ve zralý B-lymfocyt. Děje v rámci tohoto vývoje jsou často zkoumány pomocí single-cell analýzy skrze průtokovou cy- tometrii, fluorescencí aktivované třídění buněk a hmotnostní cytometrii. Propojení těchto vysoce výkonných metod s moderními přístupy k analýze dat skýtá obrovský potenciál v nacházení vzácných buněčných populací a odchylných událostí v rámci krvetvorby. Klíčová slova: B-lymfocyt, lymfopoéza, průtoková cytometrie, FACS, hmotnostní cy- tometrie, shluková analýza, FlowSOM, PCA, t-SNE, Wanderlust. 1
Klíčová slova: B-lymfocyt; FACS; FlowSOM; hmotnostní cytometrie; lymfopoéza; PCA; průtoková cytometrie; shluková analýza; t-SNE; Wanderlust; B-lymphocyte; cluster analysis; FACS; flow cytometry; FlowSOM; lymphopoiesis; mass cytometry; PCA; t-SNE; Wanderlust

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/98276

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-380496


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce