Název: Genomika speciace u slavíků
Překlad názvu: Speciation genomics in nightingales
Autoři: Mořkovský, Libor ; Reifová, Radka (vedoucí práce) ; Macholán, Miloš (oponent) ; Piálek, Lubomír (oponent)
Typ dokumentu: Disertační práce
Rok: 2019
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Speciationisusuallyaslowprocessoccurringoverthousandstomillionsofyears.Thismakes speciation research difficult because no direct observation or manipulation is possible. At best, we can gain some insight by inferring the population history and structure in very fine detail by investigating genetic markers in multiple individuals of the nascent species. Today, speciationresearchisinanunprecedentedpositionthankstotheadventofhigh-throughput sequencingmethods,whichmakeiteasier and cheaper than ever before to evaluate multiple markers in many individuals. Speciation is not a straightforward process that happens in the same way every time, but rather a phenomenon occurring when genetic and ecological circumstancesactinginsymphonyultimatelyleadtoreproductiveisolationoftwosubpopula- tions. This is why it is important to study multiple model systems to understand the general principles behind speciation. We worked with two species of nightingales (Luscinia luscinia andL.megarhynchos)thatdivergedapproximately1.8Mya,likelyduetoglacialfluctuations in Europe. Our main goal was to use these new high-throughput sequencing methods to (1) detect interspecific hybrids between the species, (2) estimate levels of interspecific gene flow,(3)findareasofthenightingalegenomethatunderliereproductiveisolationand,finally, (4)... Shrnutí Speciacejeobvyklepomalýproces,kdesečasměřívtisícíchažmilionechlet.Todělávýzkum speciaceobtížným,protože"celou"speciacinelzeanipozorovat,anisníexperimentálněma- nipulovat.Nejvíceinformacíospeciacinámposkytnepodrobnápopulačnístrukturaspolečně s rekonstruovanou populační historií vybraných populací, které považujeme za vznikající nebo nedávno vzniklé druhy. Díky nedávnému vzestupu nových sekvenačních metod lze nyní zjistit genotypy mnoha jedinců ve velkém rozlišení za přijatelnou cenu. Výzkum spe- ciace tím získává nové obzory. Speciace totiž není jeden konkrétní proces, který se pokaždé odehraje podle stejného scénáře, ale spíše symfonie různých událostí, jež vedou v konečném důsledku k (trvalé) reprodukční izolaci dvou subpopulací. Proto je k pochopení celého feno- ménudůležitézkoumatpříkladyurůznýchmodelovýchsystémů.Myjsmesizvolilidvadruhy slavíků(LuscinialusciniaaL.megarhynchos),kteréseoddělilypředzhruba1,8 milionemlet, pravděpodobnědíkyposunůmzaledněníběhemstřídánídobledových.Našímhlavnímcílem bylopomocínovýchsekvenačníchmetod(1)detekovatmezidruhovéhybridy,(2)odhadnout úroveň genového toku mezi druhy, (3) najít oblasti v genomu slavíka, které podmiňují reprodukční izolaci mezi druhy a konečně (4) prozkoumat roli chromosomu Z při speciaci....
Klíčová slova: genomika; reprodukční izolace; speciace; genomics; reproductive isolation; speciation

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/110162

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-406173


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Disertační práce