Název:
Kvasinky polyfyletického rodu Cryptococcus - ich vlastnosti a výskyt v prírode
Překlad názvu:
Yeasts of polyphyletic genus Cryptococcus - characteristics and occurence in the nature
Autoři:
Švecová, Natália ; Stratilová,, Eva (oponent) ; Schusterová,, Hana (vedoucí práce) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2020
Jazyk:
slo
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstrakt: [slo][eng]
Kvasinky rodu Cryptococcus patria medzi bazídiomycéty, ktoré v prírode tvoria širokú skupinu s rôznym geografickým rozšírením. Mnohé z nich sa radia medzi ľudské patogény, ktoré ohrozujú hlavne pacientov so zníženou imunitou. Vďaka veľkej rozmanitosti na úrovni poddruhov, vykazujú jednotlivé druhy rodu Cryptococcus odlišné molekulárne charakteristiky. Ich identifikácia je zložitá, hlavne vďaka prítomnosti polysacharidovej kapsuly, ktorá obklopuje bunku niektorých druhov. Táto práca sa venuje identifikácii druhov vyskytujúcich sa na lúkach a v záhradách. 79 vzoriek kvasiniek je podrobených identifikácii prostredníctvom metódy MALDI-TOF MS. Súčasne s identifikáciou sa u vzoriek sleduje vplyv rôznych kultivačných médií na výsledky identifikácie. Keďže u mnohých druhov je prítomná kapsula, ďalším sledovaným parametrom je vplyv metódy prípravy vzorky a použitej matrice na identifikáciu. V experimentálnej časti je na úrovni druhu identifikovaných 51 vzoriek kvasiniek rodu Cryptococcus. Vybrané vzorky sú ďalej podrobené stanoveniu charakteristík prostredníctvom konvenčných mikrobiologických metód. Sledovanými parametrami sú prítomnosť ureázy, konštanta radiálneho rastu, citlivosť na antimykotiká, fermentácia a asimilácia cukrov, rast v prítomnosti alkoholov a rast bez prítomnosti vitamínov. Na základe mikrobiologických výsledkov sú vzorky približne zaradené do jednotlivých druhov kvasiniek. Biotypizácia priniesla zaradenie vybraných vzoriek do druhov Filobasidium magnum, Filobasidium oeirense a Filobasidium wieringae. Ďalšie vzorky vykazovali nejednoznačnú identifikáciu. Tieto druhy však majú rovnaké vlastnosti, takže ich nebolo možné rozlíšiť zvolenými mikrobiologickými testami.
Yeasts of genus Cryptococcus belong to the Basidiomycetes, a wide group with different geographical sharing in nature. Many of them rank among human pathogens that endanger immunocompromised patients. Thanks to the big diversity at the level of subspecies, various species of the genus Cryptococcus show different molecular characteristics. Their identification is difficult because of the presence of polysaccharide capsule that surrounds the cell of some species. This work deals with the identification of species occurring in meadows and gardens. The 79 yeasts samples are identified by MALDI-TOF MS. The influence of different culture media on the identification results is monitored simultaneously with the identification. Since a capsule is present in many species, another parameter to be monitored is the influence of the sample preparation method and the matrix on the identification. 51 samples of yeasts of the genus Cryptococcus are identified at the species level in the experimental part. Selected samples are further subjected to the determination of characteristics by conventional microbiological methods. The determined parameters are the presence of urease, radial growth constant, susceptibility to antimycotics, fermentation and assimilation of sugars, growth in the presence of alcohols and growth in the absence of vitamins. The yeast samples are classified into yeast species based on microbiological results. Biotyping resulted in identification of selected samples in the species Filobasidium magnum, Filobasidium oeirense and Filobasidium wieringae. Other samples showed ambiguous identification. As these species have the same properties, they could not be distinguished by the selected microbiological tests.
Klíčová slova:
Biotyping; MALDI-TOF MS; the genus of Cryptococcus
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/190998
host ::
