Název: Vliv vybraných endogenních a exogenních faktorů na bakteriální růst
Překlad názvu: The effect of selected endogenous and exogenous factors on bacterial growth
Autoři: Šiková, Michaela ; Krásný, Libor (vedoucí práce) ; Valášek, Leoš (oponent) ; Vopálenský, Václav (oponent)
Typ dokumentu: Disertační práce
Rok: 2020
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
The growth of bacteria by binary division is a key characteristic of these organisms. This growth depends on two types of factors: endogenous and exogenous. Endogenous factors make up the molecular apparatus of cells. Among important endogenous factors belong also those involved in gene expression and its regulation. Exogenous factors are external conditions such as nutrient availability, temperature, pH, various stresses or the presence of antibacterial agents. The main aim of my Thesis was to study the effects of selected endogenous and exogenous factors on bacterial growth. As endogenous factors I studied RNase J1 in Bacillus subtilis and a small RNA called Ms1 in Mycobacterium smegmatis, which are involved in regulation of gene expression at the transcriptional level. I showed that RNase J1 can, besides its role in RNA degradation, play a role in genome integrity by removing stalled RNA polymerase (RNAP) complexes from DNA. I further showed that Ms1 binds to the RNAP core and affects the level of RNAP in the cell. The results revealed new mechanistic aspects of the transcription apparatus and show how individual components or their combinations affect bacterial growth. As exogenous factors I studied the recently discovered antibacterial compounds, called lipophosphonoxins, their interaction... Růst bakteriální kultury binárním dělením je klíčovou charakteristikou těchto organismů. Tento růst závisí na dvou typech faktorů: endogenní a exogenní. Endogenní faktory tvoří molekulární aparát buněk. Mezi důležité endogenní faktory patří rovněž ty, které se podílejí na genové expresi a její regulaci. Mezi exogenní faktory řadíme dostupnost živin, teplota, pH, různé stresy nebo přítomnost antibiotik. Hlavním cílem mé dizertační práce bylo studium vlivů vybraných endogenních a exogenních faktorů na bakteriální růst. Jako endogenní faktory jsem studovala RNázu J1 u Bacillus subtilis a malou RNA zvanou Ms1 u Mycobacterium smegmatis, které se podílejí na regulaci genové exprese na úrovni transkripce. Ukazuji zde, že RNáza J1 může, kromě své role v degradaci RNA, hrát roli v genomové integritě odstraněním zastavených komplexů RNA polymerázy (RNAP) z DNA. Dále ukazuji, že Ms1 se váže na jádro RNAP a má vliv na množství RNAP v buňce. Výsledky odhalují nové mechanistické aspekty transkripčního aparátu a ukazují, jak jednotlivé komponenty nebo kombinace ovlivňují bakteriální růst. Jako exogenní faktory jsem studovala nedávno objevené antibakteriální látky zvané lipofosfonoxiny a jejich interakci s bakteriemi, bakteriálními proteiny a vliv na bakteriální růst. Stručně řečeno, tato práce posouvá naše...
Klíčová slova: podjednotka; RNA polymeráza; RNAsa; sRNA; transkripce; RNA polymerase; RNAse; sRNA; subunit; transcription

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/120584

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-434583


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Disertační práce