Název:
Studium retence a separace peptidů v HPLC
Překlad názvu:
Study of retention and separation of peptides in HPLC
Autoři:
Boudová, Hana ; Kalíková, Květa (vedoucí práce) ; Kubíčková, Anna (oponent) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2023
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Tato diplomová práce se zabývá studiem retence a separace strukturně odlišných peptidů a štěpných produktů cytochromu c pomocí kapalinové chromatografie v reverzním a smíšeném (mix) módu. Mezi modelové peptidy bylo vybráno pět nemodifikovaných dipeptidů, devět dipeptidů obsahující chránicí benzoylovou skupinu na N-koncové aminokyselině a osm terapeutických peptidů (penta- až dekapeptidy). Chromatografické chování modelových peptidů bylo testováno na třech různých kolonách: XBridge C18, XSelect CSH C18 a Atlantis Premier BEH C18 AX za různých podmínek. Byl testován vliv pH vodné složky mobilní fáze, tj. 2,1; 3,0; 4,7 a 6,8, a množství acetonitrilu v mobilní fázi na retenci a separaci vybraných peptidů. Dále byl sledován vliv koncentrace octanu amonného o pH = 6,8 v mobilní fázi na retenci a symetrii píků peptidů v koncentračním rozmezí 10-50 mmol l-1 . Byly optimalizovány chromatografické podmínky pro separaci 20 modelových peptidů na základní linii na koloně XSelect CSH C18 v mobilní fázi acetonitril/10mM octan amonný, pH = 6,8, (v/v) za použití gradientové eluce. V rámci této práce byly také optimalizovány chromatografické podmínky pro analýzu a identifikaci fragmentů trypticky naštěpeného cytochromu c. Mix mód kolona Atlantis Premier BEH C18 AX vykazovala nejvyšší selektivitu pro sledované...This diploma thesis deals with the study of retention and separation of structurally different peptides and digest products of cytochrome c using reverse phase and mixed modes of liquid chromatography. As the model peptides, five unmodified dipeptides, nine dipeptides containing a protective benzoyl group on the N-terminal amino acid and eight therapeutic peptides containing five to ten amino acids were selected. The chromatographic behaviour of the model peptides was tested on three different columns: XBridge C18, XSelect CSH C18 and Atlantis Premier BEH C18 AX under different conditions. The influence of the pH of the aqueous part of the mobile phase, i.e. 2,1; 3,0; 4,7 and 6,8, and the amount of acetonitrile in the mobile phase on retention and separation of model peptides was tested. The effect of the concentration of ammonium acetate buffer, pH = 6,8 in the mobile phase on the retention and peak symmetry in the concentration range of 10-50 mmol L-1 was assessed. The chromatographic conditions for the baseline separation of 20 different model peptides were optimized. The conditions were as follows: XSelect CSH C18 column, mobile phase composed of acetonitrile/10mM ammonium acetate, pH = 6,8 (v/v) under gradient elution. The suitable chromatographic conditions for the analysis and identification...
Klíčová slova:
cytochrom c; peptid; retence; separační mód; stacionární fáze; vysokoúčinná kapalinová chromatografie; cytochrome c; high performance liquid chromatography; peptide; retention; separation mode; stationary phase