Název: Role WIP1 fosfatázy v jadérku
Překlad názvu: Role of the WIP1 phosphatase in the nucleolus
Autoři: Palková, Natálie ; Macůrek, Libor (vedoucí práce) ; Sztacho, Martin (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2023
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Protein phosphatase 2C delta (known as WIP1) is an important negative regulator of the DNA damage response (DDR) signalling. As a chromatin-bound protein, it dephosphorylates and thus inactivates ATM kinase and the transcription factor p53. Increased expression of WIP1 suppresses the function of the tumour suppressor p53 and contributes to the development of several cancer types, including breast and brain tumours. In recent years, it has been shown that WIP1 can also regulate cellular processes that are not directly linked to DDR, such as ensuring telomere stability. However, alternative functions of the WIP1 protein have not yet been fully understood. In this work, we described a novel role of the WIP1 phosphatase in the nucleolus, the organelle responsible for ribosome biogenesis. We found that WIP1 associates with many nuclear proteins, and using deletion mutants, we identified a nucleolar localisation sequence (NoLS) at the C-terminus of the protein. Using super-resolution microscopy, we detected the localisation of WIP1 phosphatase in the fibrillar centres of the nucleolus. We employed an inducible Cas9 system for generating double-strand breaks in ribosomal DNA and found that WIP1 has an impact on recruitment of DNA repair factors to the nucleolar caps. Analysis based on quantitative... Protein fosfatáza 2C delta (známá jako WIP1) je důležitým negativním regulátorem signalizace odpovědi buňky na poškození DNA (DDR). Jako protein vázaný na chromatin defosforyluje, a tedy inaktivuje ATM kinázu a transkripční faktor p53. Zvýšená exprese WIP1 potlačuje funkci tumour supresoru p53 a přispívá k rozvoji řady nádorových onemocnění včetně nádorů prsu a mozku. V posledních letech bylo ukázáno, že WIP1 může regulovat rovněž buněčné procesy, které nejsou přímo spojeny s DDR, jako je například zajištění stability telomer. Alternativní funkce proteinu WIP1 však nebyly dosud plně pochopeny. V této práci jsme popsali novou roli proteinu WIP1 v jadérku, organele zodpovědné za produkci ribozomů. Zjistili jsme, že WIP1 asociuje s mnoha jadérkovými proteiny, a pomocí delečních mutant jsme identifikovali jadérkovou lokalizační sekvenci (NoLS) na C-konci proteinu. Pomocí super-rezoluční mikroskopie jsme identifikovali lokalizaci WIP1 fosfatázy ve fibrilárních centrech jadérka . Za použití inducibilního Cas9 systému pro generování dvouřetězcových zlomů v rDNA jsme dále zjistili, že WIP1 ovlivňuje akumulaci faktorů zajišťujících opravu poškození DNA. Analýza založená na kvantitativní mikroskopii ukázala, že aktivita WIP1 má vliv také morfologii jadérka. Na základě našich výsledků usuzujeme, že WIP1...
Klíčová slova: fosfatáza; fosforylace; jadérko; transkripce; nucleolus; phosphatase; phosphorylation; transcription

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/185546

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-535351


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce