Název: Identifikace nekódující RNA u Clostridium beijerinckii NRRL B-598 pomocí RNA-Seq dat
Překlad názvu: Identification of non-coding RNAs of Clostridium beijerinckii NRRL B-598 using RNA-Seq data
Autoři: Pomykalová, Barbora ; Sedlář, Karel (oponent) ; Jurečková, Kateřina (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2021
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce obsahuje stručný úvod do problematiky nekódujících malých RNA u bakterií (sRNA). Zaměřuje se na jejich vlastnosti a funkce v organismu a to konktrétně pro bakterii Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Dále obsahuje popis laboratorních metod pro stanovení genové exprese a navrhuje postup pro identifikaci malých nekódujících RNA z dat získaných metodou RNA-Seq, pro zkoumanou bakterii Clostridium beijerinckii NRRL B-598. V neposlední řadě dochází k implementaci navrženého postupu v prostředí MATLAB a zhodnocení výsledků získaných touto metodou. This bachelor thesis contains short introduction into bacterial small non-coding RNA problematic. It is oriented on their features and functions in organisms, especially in bacteria Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Bachelor thesis also contains description of various laboratory methods for gene expression determination and suggests a detection method for small non-coding RNA in bacteria Clostridium beijerinckii NRRL B-598. Suggested method works with data, which were obtained by RNA-Seq technology. Within the framework of the bachelor thesis was suggested method implemented in programming and numeric computing platform MATLAB and its results were discussed.
Klíčová slova: bakterie; detekce; genová exprese; MATLAB; RNA; RNA-Seq; sekvenování; sRNA; bacteria; detection; gene expression; MATLAB; RNA; RNA-Seq; sequencing; sRNA

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/198497

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-587697


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce