Preparation and storage of fish samples for flow cytometry
Halačka, Karel; Vetešník, Lukáš; Mareš, J.
2018 - Czech Flow cytometry enabling rapid measurement of cellular DNA content has been widely used in ichthyology and fishery practice. The aim of the methodology is to contribute to optimization of work on the flow cytometer by helping with the selection, sampling and possibilities of fixation of analyzed tissue and interpretation of obtained data. The target group are people from fishery companies and ichthyologists dealing with the problem of the fish population structure in free water. During the sampling and analyzing of samples problem can be limited availability of fixative and techniques as well as analyzes of material not originally retained for the purpose of ploidy determination. Typical examples are temporary usable or archive preparations, museum material, etc. For the verification were preferred representatives of polyploid complexes or economically exploited species with a known existence of polyploid individuals. Průtoková cytometrie umožňující rychlé měření obsahu DNA buněk našla široké využití v ichtyologii i rybářské praxi. Cílem metodiky je přispět k optimalizaci práce na průtokovém cytometru a to pomocí při výběru, odběru a možností fixace analyzovaná tkáně a interpretace získaných dat. Cílovou skupinou dané metodiky jsou zejména osoby z rybářské praxe a ichtyologové zabývající se problematikou populační struktury ryb ve volných vodách, s čímž souvisí i například omezená možnost fixačních prostředků a technik, případně snaha analýz materiálu původně neuchovaného pro účely stanovení ploidie (dočasné pracovní či archivní preparáty, muzejní materiál, atd.). Při výběru druhů k ověření byly preferovány představitelé polyploidních komplexů či hospodářsky využívané druhy se známou existencí polyploidních jedinců. Keywords: Fish farming; DNA analyses; erythrocytes Fulltext is available at external website. Preparation and storage of fish samples for flow cytometry

Flow cytometry enabling rapid measurement of cellular DNA content has been widely used in ichthyology and fishery practice. The aim of the methodology is to contribute to optimization of work on the ...

Halačka, Karel; Vetešník, Lukáš; Mareš, J.
Ústav biologie obratlovců, 2018

Zoological days Praha 2018: book of abstracts
Bryja, Josef; Solský, M.
2018 - Czech Keywords: Zoology; conference Fulltext is available at external website. Zoological days Praha 2018: book of abstracts

Bryja, Josef; Solský, M.
Ústav biologie obratlovců, 2018

Utilization of polymerase chain reaction, PCR-RFLP technique and sequence analysis for determination of homozygotes, intraspecific heterozygotes and interspecific hybrids of the genus Salvelinus in breeding facilities
Mendel, Jan; Halačka, Karel; Mareš, J.
2017 - Czech The methodology provides relevant information and reliable instruments for determination of the most frequently bred fish of the genus Salvelinus in the Czech Republic and in European countries. It includes the optimized process of identification of four species (Salvelinus fontinalis, Salvelinus alpinus, Salvelinus umbla, Salvelinus namaycush) in the homozygous and heterozygous state and in their hybrid combinations. The methodology describes the present situation in identification of the above mentioned fish species in the Czech Republic including its drawbacks and at the same time proposes a new and reliable solution utilizing polymerase chain reaction, PCR-RFLP restriction technique and sequencing. Visualization and separation of diagnostic fragments is performed either on agarose gel or on the Fragment AnalyzerTM. Cílem metodiky je poskytnout relevantní informace a spolehlivé nástroje k determinaci nejčastěji chovaných ryb rodu Salvelinus v ČR a v evropských státech. Metodika obsahuje optimalizovaný postup identifikace čtyř druhů (Salvelinus fontinalis, Salvelinus alpinus, Salvelinus umbla, Salvelinus namaycush) v homozygotním i heterozygotním stavu a v jejich hybridních kombinacích. Metodika popisuje aktuální stav identifikace uvedených druhů ryb v ČR včetně jejich nedostatků a současně navrhuje nové a spolehlivé řešení s využitím polymerázové řetězové reakce, restrikční techniky PCR-RFLP a sekvenace. Vizualizace a separace fragmentů je prováděna buď na agarózovém gelu anebo na přístroji Fragment AnalyzerTM. Keywords: Salvelinus; PCR-RFLP technique; breeding facilities Fulltext is available at external website. Utilization of polymerase chain reaction, PCR-RFLP technique and sequence analysis for determination of homozygotes, intraspecific heterozygotes and interspecific hybrids of the genus Salvelinus in breeding facilities

The methodology provides relevant information and reliable instruments for determination of the most frequently bred fish of the genus Salvelinus in the Czech Republic and in European countries. It ...

Mendel, Jan; Halačka, Karel; Mareš, J.
Ústav biologie obratlovců, 2017

Kvalita prostředí a potravní chování kapra ve vztahu k přikrmování v polointenzivní rybniční akvakultuře
Adámek, Zdeněk; Jurajda, Pavel; Zukal, Jan; Janáč, Michal; Mikl, Libor; Šlapanský, Luděk; Všetičková, Lucie; Prášek, Václav; Šútovský, I.; Chytka, V.; Mrkvová, Markéta
2017 - Czech Kombinací čtyř metod terénního výzkumu (telemetrie, elektrolov, potravní analýzy a měření parametrů vody) se ukázalo, že ryby nejsou v polointenzivním rybničním chovu rozmístěny rovnoměrně. Dominantní jedinci se koncentrují v krmných místech v hustotě, která může snížit obsah kyslíku až k hranici fyziologického minima, což vede k horšímu využití krmiv. Menší ryby se zdržují spíše mimo krmná místa a v okrajích rybníka a živí se převážně přirozenou potravu. Kromě menší hmotnosti mají i nižší obsah tuku. Rozdělení obsádky kapra na větší jedince s vyšším obsahem tuku, významně se orientující na krmná místa, a na menší s nižším obsahem tuku živící se více přirozenou potravou vede k doporučení vhodnosti rozšíření aplikace krmiv na více krmných míst, případně jejich střídání. Keywords: carp; food; aquaculture Fulltext is available at external website. Kvalita prostředí a potravní chování kapra ve vztahu k přikrmování v polointenzivní rybniční akvakultuře

Kombinací čtyř metod terénního výzkumu (telemetrie, elektrolov, potravní analýzy a měření parametrů vody) se ukázalo, že ryby nejsou v polointenzivním rybničním chovu rozmístěny rovnoměrně. Dominantní ...

Adámek, Zdeněk; Jurajda, Pavel; Zukal, Jan; Janáč, Michal; Mikl, Libor; Šlapanský, Luděk; Všetičková, Lucie; Prášek, Václav; Šútovský, I.; Chytka, V.; Mrkvová, Markéta
Ústav biologie obratlovců, 2017

Zoological days Brno 2017: book of abstracts
Bryja, Josef; Horsák, M.; Horsáková, V.; Řehák, Z.; Zukal, Jan
2017 - Czech Keywords: zoology; conference Fulltext is available at external website. Zoological days Brno 2017: book of abstracts

Bryja, Josef; Horsák, M.; Horsáková, V.; Řehák, Z.; Zukal, Jan
Ústav biologie obratlovců, 2017

Morphological differences in farm groups of salmonid fishes
Halačka, Karel
2016 - Czech The aim of this study was examination of a influence species/line and stock conditions. This paper record first results form three groups of salmonid fishes – rainbow trout (from Italy and Denmark) and brook trout hybrides (S. fontinalis x S. alpinus). There were choosen morphological parameters observed – body contruction, weigth of intestine organs, epidermal and gill structure and erythrocyte size. Cílem studie je posouzení vlivu druhu/linie a podmínek chovu. Tato práce zachycuje první průběžné výsledky získané na základě tří skupin lososovitých ryb – pstruha duhového původem z Itálie, z Dánska a hybridních jedinců sivena (S. fontinalis x S. alpinus). Sledovány byly vybrané morfologické parametry – stavba těla, hmotnost vnitřních orgánů, struktura pokožky a žáber a velikost krvinek. Keywords: morphology; brook trout; rainbow trout; hybrids Fulltext is available at external website. Morphological differences in farm groups of salmonid fishes

The aim of this study was examination of a influence species/line and stock conditions. This paper record first results form three groups of salmonid fishes – rainbow trout (from Italy and Denmark) ...

Halačka, Karel
Ústav biologie obratlovců, 2016

Zoological days České Budějovice 2016: book of abstracts
Bryja, Josef; Sedláček, F.; Fuchs, R.
2016 - Czech Keywords: zoology; conference Fulltext is available at external website. Zoological days České Budějovice 2016: book of abstracts

Bryja, Josef; Sedláček, F.; Fuchs, R.
Ústav biologie obratlovců, 2016

Toxic effect of fluorescence pigment on zebra fish (Danio rerio)
Poštulková, E.; Mareš, J.; Halačka, Karel; Kopp, R.
2016 - English The aim of the study was to determine the toxic effects of organic pigments Alizarin Red S and Alizarin Complexone on zebra fish (Danio rerio). For short-term acute toxicity tests on zebra fish concentration of 150; 300 and 600 mg/L were chosen for both dyes. Toxic effect of dyes was observed even in the variant with 10 g/L of sodium chloride. Addition of sodium chloride increases the deposition of dyes in the bone structures of the fish. LC50 values were analyzed graphically by using probit analysis. There was no mortality during the acute toxicity test with Alizarin Red S even at the highest concentration. Toxicity value (72hLC50) for zebra fish with a combination of Alizarin Red S + 10 g/L of sodium chloride is 546.42 mg/L. Mortality for Alizarin Complexone was 100% in 24 hours at\nconcentrations of 300 and 600 mg/L, with concentrations of 150 mg/L there was no mortality. In Alizarin Complexone supplemented with 10 g/L of sodium chloride was 100% mortality at all\nconcentrations up to 72 hours. Keywords: Alizarin Red S; Alizarin Complexone; LC50; fish; marking Fulltext is available at external website. Toxic effect of fluorescence pigment on zebra fish (Danio rerio)

The aim of the study was to determine the toxic effects of organic pigments Alizarin Red S and Alizarin Complexone on zebra fish (Danio rerio). For short-term acute toxicity tests on zebra fish ...

Poštulková, E.; Mareš, J.; Halačka, Karel; Kopp, R.
Ústav biologie obratlovců, 2016

Resource material for production of salmonid fish in the Czech Republic – past and present. Questionnaire – breeding practice in the Czech Republic\n
Mendel, Jan
2016 - Czech To determine the present state a questionnaire was prepared with 17 questions mapping the following topics: control and knowledge of the lineage bred, outline of the reproduction technologies and alternative genetically improved techniques used, sign and type of the selection made, type of the breeding method involved, knowledge and degree of utilization of genetic tools, knowledge of the latest breeding programs used abroad. Pro zjištění současného stavu byl připraven dotazník s 17 otázkami mapujícími okruhy: kontrola a znalost chované linie, nástin používaných reprodukčních technologií a alternativních geneticky vylepšovaných technik, znak a typ prováděna selekce, typ používané šlechtitelské metody, znalost a míra používání genetických nástrojů, informovanost o nejnovějších chovných programech v zahraničí. Keywords: genetic tools; breeding practice; Salmonidae Fulltext is available at external website. Resource material for production of salmonid fish in the Czech Republic – past and present. Questionnaire – breeding practice in the Czech Republic\n

To determine the present state a questionnaire was prepared with 17 questions mapping the following topics: control and knowledge of the lineage bred, outline of the reproduction technologies and ...

Mendel, Jan
Ústav biologie obratlovců, 2016

Controlled farming – contribution of genetics to the purpose of breeding of salmonid fish
Mendel, Jan
2016 - Czech There was made a short survey of practical utilization of genetics in the following spheres: identification of lineages, species and hybrids, utilization of genomic information in breeding programs and selection procedures, sex determination, searching for important QTLs. Byl učiněn stručný přehled praktického využití genetiky v oblastech: identifikace linií, druhů a hybridů, využití genomické informace v chovných programech a selekčních procedurách, sex determinace, vyhledávání významných QTL. Keywords: genetics; breeding programs; selection; Salmonidae Fulltext is available at external website. Controlled farming – contribution of genetics to the purpose of breeding of salmonid fish

There was made a short survey of practical utilization of genetics in the following spheres: identification of lineages, species and hybrids, utilization of genomic information in breeding programs ...

Mendel, Jan
Ústav biologie obratlovců, 2016